编辑 | 白菜叶
纵向大量和单细胞组学数据越来越多地用于生物学和临床研究,但由于其许多内在类型的变异而难以分析。
艾伦免疫学研究所(Allen Institute for Immunology)的研究人员介绍了 PALMO ,这是一个包含五个分析模块的平台,用于从多个角度检查纵向批量和单细胞多组学数据,包括分解数据中的变异源, 收集跨时间点和参与者的稳定或可变特征,跨时间点识别单个参与者的上调或下调标记,以及调查同一参与者的样本从而了解可能的异常事件。
该团队已经在复杂的纵向多组学数据集上测试了 PALMO 的性能,该数据集包含相同样本的五种数据模式和不同背景的六个外部数据集。PALMO 和这里使用的纵向多组学数据集都可以成为科学界的宝贵资源。
该研究以「A comprehensive platform for analyzing longitudinal multi-omics data」为题,于 2023 年 3 月 27 日发布在《Nature Communications》。
PALMO:https://github.com/aifimmunology/PALMO
论文链接:https://www.nature.com/articles/s41467-023-37432-w